La Fédération conçoit le scoutisme comme moyen d’apostolat dans l’Église; néanmoins, elle ne voit pas l’utilisation de la méthode scoute comme une fin en soi mais comme un instrument pour la formation d’hommes et de femmes authentiques, insérés dans un chemin surnaturel où ils réalisent les valeurs évangéliques au service du monde.
L’U.I.G.S.E.-F.S.E. réunit des associations scoutes de confession catholique. Elle pose l’ensemble de ses actes et de ses décisions conformément aux règles de cette foi. Toutefois, dans un esprit d’ouverture œcuménique, l’U.I.G.S.E.-F.S.E. accueille aussi des associations d’autres confessions chrétiennes selon les conditions établies par le Directoire Religieux. La règle intangible de l’U.I.G.S.E.-F.S.E. est de ne pas réunir dans les mêmes unités des garçons ou des filles de confessions différentes.
Dans cette optique œcuménique, l’usage du terme F.S.E. – plutôt que U.I.G.S.E. ou U.I.G.S.E.-F.S.E. – est resté dans diverses associations car ce sigle correspond à quelque chose de plus large aux yeux des communautés évangéliques et orthodoxes qui font partie de la Fédération.